단일 세포 오믹스

평판형 단일 세포 오믹스 워크플로를 위한 확장형 플랫폼

새로운 방법

최근 단일 세포 분석을 위한 계측, 생화학 및 전산 도구의 발전으로 암 연구 및 면역학 등 다양한 생물학 분야에서 단일 세포 방법이 빠르게 채택되었습니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱은 현재까지 가장 널리 사용되는 기술이지만, 단일 세포 단백질체학과 단일 세포 멀티 오믹스를 위한 여러 가지 유망한 방법이 등장하고 있습니다.

평판형 단일 세포 오믹스 워크플로를 위한 자동화된 플랫폼

정기적으로 고처리량 단일 세포 분석을 수행하려면 안정된 계측이 필요합니다. 동시에 매우 역동적인 이 분야는 다양한 분석에 적응할 수 있는 유연한 플랫폼의 사용을 요구합니다. 그러므로 당사는 단일 세포 RNA 시퀀스, 단일 세포 게놈 시퀀싱, 단일 세포 단백질체학 및 단일 세포 다중 오믹스에 대한 최근 분석 등 평판형 단일 세포 분석 워크플로를 위한 개방적이고 안정되고 자동화된 플랫폼을 제공합니다.

이미지 기반 세포 격리

당사의 단일 세포 디스펜싱 기술은 촬영 기반 비표지 세포 격리를 지원합니다. 또한 불용 세포 또는 대상 하위모집단을 제하기 위해 형광 마커를 기반으로 세포를 정렬할 수 있습니다. 세포 격리 프로세스는 일련의 이미지에 의해 문서화됩니다. 해당 이미지는 단일 세포가 사실상 격리되었다는 증거를 제공할 뿐만 아니라 크기, 안정성 또는 형광 강도 등 세포 형태학의 특성도 문서화합니다. 그런 다음, 이러한 매개변수를 라이브러리 크기 또는 시퀀싱 데이터에 연결할 수 있습니다.

마이크로리터 이하 액체 체적의 세포 용해

차세대 시퀀싱(NGS) 라이브러리의 정확한 단일 세포 분석과 준비를 위한 전제조건은 대량 샘플에서 세포를 효율적으로 격리하고 PCR 평판에 정밀하게 침착하는 것입니다. 당사의 단일 세포 디스펜싱 계측기에는 각 웰의 중심에 세포가 침착되도록 보장하여 마이크로리터 이하 체적(예: 350 nL)의 세포 용해가 가능하도록 자동화된 오프셋 보정(AOC) 모듈을 장착할 수 있습니다.

분석 초소형화

I-DOT 비접촉 액체 핸들러를 이용하여 분석 초소형화 및 비용 절감

자동화된 액체 취급은 전달 시간 및 조작자 편견을 줄여주므로 정기적인 단일 세포 라이브러리 준비에 매우 중요합니다. 비접촉 액체 취급 기기를 사용하면 교차 감염의 위험이 낮아지며 피펫 팁 수천 개가 절약됩니다. 값비싼 시약과 분석할 세포 수의 증가 때문에 마이크로리터 이하 시약 디스펜싱은 더 많은 실험실이 채택하고 있습니다. I-DOT 적은 체적 디스펜싱 기술을 사용하여 표준 반응량 10분의 1로 smart-seq2 및 NGS 라이브러리 준비 수행에 대해 더 자세히 알아보십시오.

NGS 라이브러리의 정량화 및 정규화

일반적으로 단일 세포에서 cDNA를 증폭하면 농도가 불균일해지기 때문에 모든 세포에 대해 균일한 판독 분포를 보장하려면 정규화가 필요할 수 있습니다. I-DOT를 사용하면 수백 가지 라이브러리를 수 분 이내에 정량화 및 정규화할 수 있어 최대 96 가지 시약을 병렬로 고도로 다중화하여 디스펜싱할 수 있습니다.

라이브러리 인덱싱 및 조기 바코드 작성

NGS 라이브러리를 고유한 DNA 바코드로 인덱싱하는 기능은 고처리량 단일 세포 시퀀싱을 위한 기초를 제공합니다. 단일 세포 전체 길이 전사 시퀀싱 또는 전체 엑솜 시퀀싱의 경우, 개별 라이브러리는 대개 증폭 및 단편화 후에 인덱싱됩니다. CEL-Seq2 등의 다른 RNA 시퀀싱 프로토콜은 단일 세포의 조기 바코드 작성 및 풀링을 사용하기 때문에 역전사 전에 수백 가지의 바코드가 있는 프라이머를 추가해야 합니다. 바코드 프라이머 간의 교차 감염은 적절한 역다중화를 불가능하게 만들 수 있기 때문에 피해야 합니다.

복잡한 작업을 타의 추종을 불허하는 속도로 수행

 I.DOT 비접촉 디스펜싱 기술은 가장 복잡한 액체 취급 작업도 타의 추종을 불허하는 속도로 수행하기 위해 개발되었습니다. 단일 I-DOT 소스 평판으로 최대 2304 개의 라이브러리에 고유하게 바코드를 작성할 수 있습니다. 고유한 바코드 96 개를 디스펜싱하는 데 60 초도 걸리지 않습니다.

전체 길이 전사 시퀀싱

현재까지 smart-seq2 및 해당 변형은 단일 세포 RNA 시퀀싱을 위해 가장 예민하고 인기있는 프로토콜입니다. 다른 방법과 달리 smart-seq2는 전체 길이 전사 커버리지를 제공하는 평판형 분석이므로 동형, 대안 스플라이싱 이벤트 및 돌연변이에 접근할 수 있습니다.

단일 세포 RNA 시퀀싱에서 단일 세포 단백질체학 및 멀티 오믹스까지

당사의 평판형 단일 세포 워크플로용 플랫폼은 개방적이고 다목적성이며, 따라서 널리 사용되는 모든 단일 세포 분석 워크플로와 호환됩니다. 당사의 경험이 풍부한 응용 과학자팀은 고처리량 단일 세포 RNA 시퀀싱 프로토콜과 새로운 단일 세포 단백질체와 멀티 오믹스 분석의 설정 및 최적화에 있어 고객을 기꺼이 지원하겠습니다.

관련 애플리케이션 노트

추천 워크플로

샘플 준비

단일 세포 격리

라이브러리 준비

시퀀싱 및 분석

고객의 워크플로 전체에 걸쳐 효율성 개선

F.SIGHT™

세균, 효모 및 기타 작은 균류의 고처리량 단일 세포 격리를 활성화하여 고객의 시간과 자원을 절약합니다.

B.SIGHT™

96웰 또는 384웰 평판에서 원핵 세포를 격리합니다. 20배 배율로 밝은 부분 노즐을 촬영합니다. 배양, 유전체학 또는 질량 분석용 단일 세균을 정렬합니다.

I-DOT

비접촉 액체 취급 작업을 위한 고급 솔루션. 직관적인 자동화, 정밀도 및 속도를 제공하도록 고객의 워크플로를 최적화합니다.

SC 고속 단일 세포 RNAseq

확장 가능하고 비용 효과적인 단일 세포 전사체 분석을 위한 철저한 라이브러리 준비.