차세대 시퀀싱
차세대 시퀀싱을 위한 적은 체적 디스펜싱 및 라이브러리 준비 초소형화
소개
차세대 시퀀싱(NGS)은 미생물 게놈과 전사체를 포함한 다양한 샘플과 호환되는 고처리량 시퀀싱 방법입니다. 시퀀싱 전에 게놈은 더 작은 크기로 단편화되며 시퀀싱 중의 흐름 세포 부착을 위해 어댑터가 도입됩니다. 해당 어댑터는 다중화를 위해 바코드 또는 인덱스를 포함할 수 있습니다. 그러므로 샘플의 NGS 라이브러리 준비는 시퀀싱 전의 중요한 최종 단계입니다.
NGS 라이브러리 준비는 전체 워크플로 비용 중 상당한 부분을 차지하며, 라이브러리 준비의 초소형화를 통해 전체 비용을 줄이면서도 고품질의 샘플을 생성할 수 있습니다. 또한 많은 라이브러리를 동시에 시퀀싱하는 경우 비용이 더 중요해집니다. I.DOT는 여러 종류의 NGS 라이브러리 프로토콜을 수행하는 유연성을 유지하면서도 쉬운 반응 초소형화를 제공합니다.
정규화
인덱싱
정화
시퀀싱
적은 체적 비접촉 디스펜싱을 위한 즉시 드롭 온 디맨드(I-DOT) 기술
I.DOT는 비접촉 액체 취급 작업을 최적화하기 위한 특허받은 접근법입니다. 이 시스템은 개별적으로 제어되는 양성 압력 채널 8 개를 사용하여 각 웰의 바닥에 있는 작은 출구에서 8 ~ 50 나노리터의 방울을 생성합니다. 각 채널은 방울을 초당 최대 100 개까지 생성할 수 있어 8 나노리터에서 80 마이크로리터 범위의 체적을 사용할 수 있습니다. 비접촉 디스펜싱은 NGS 라이브러리 준비 중에 필요한 피펫 팁 수를 크게 줄이며 적은 체적 디스펜싱(불용 체적 1 µL 미만)은 대폭적인 시약 비용 절약을 제공합니다.
NGS 라이브러리의 정량화 및 정규화
일반적으로 모든 샘플에 대해 균일하게 판독하는 분포를 보장하려면 입력 DNA를 NGS 라이브러리 준비 전에 정규화해야 합니다. I.DOT를 사용하면 수백 가지 라이브러리를 수 분 이내에 정량화 및 정규화할 수 있어 최대 96 가지 시약을 병렬로 고도로 다중화하여 디스펜싱할 수 있습니다. 추가 비용 절감을 위해 염료 기반 정규화 분석을 위한 시약 체적을 크게 축소할 수 있습니다.
바코드 작성을 위한 빠르고 단순화된 DNA 인덱싱
단일 I-DOT 소스 웰 평판은 최대 96 가지 바코드 프라이머를 포함할 수 있으며, 이는 NGS 샘플의 고처리량 인덱싱 또는 바코드 작성을 위해 강력한 기능입니다. 96 웰 소스 평판 1 개로 샘플 2,000 개의 바코드를 고유하게 작성할 수 있으므로 I-DOT는 고처리량 처리와 즉시 호환됩니다. I-DOT의 직관적인 소프트웨어를 사용하여 복잡한 바코드 작성 프로토콜을 쉽게 생성할 수 있습니다. 비접촉 적은 체적 기술을 사용하면 교차 감염의 위험을 제거하면서 수천 개의 피펫 팁을 절약할 수 있습니다.
Karolinska Institutet