单细胞组学

适于微孔板类工作流程的可扩展平台

新兴方法

随着单细胞分析用仪器、生物化学和计算工具的最新进展,推动了单细胞方法在许多不同的生物学学科(例如癌症研究、免疫学等)得以快速采用。虽然单细胞 RNA 测序是到目前为止使用最为广泛的技术,但基于单细胞蛋白组学和单细胞多组学的几种极具前景的方法也正在逐渐兴起。

适于微孔板类单细胞分析工作流程的自动化平台

常规执行高通量单细胞分析需要强大的仪器支撑。同时,由于该领域极具动态性,因此需要使用可适应各种不同检测的灵活平台。为此,我们针对微孔板类单细胞分析工作流程提供了一个开放、稳健的自动化平台,涵盖了单细胞 RNA 测序、单细胞基因组测序、单细胞蛋白组学以及最新的单细胞多组学检测等工作流程。

基于图像的细胞分离

我们的单细胞点样技术可实现基于图像的无标记细胞分离。此外,该技术可以基于荧光标记对细胞进行分类,排除死细胞或靶标亚群。细胞分离过程会通过一系列图像予以记录。这些图像不仅提供了单细胞的实际分离证据,还记录了各种细胞形态参数,例如大小、圆度或荧光强度等。之后,这些参数会被链接到文库大小或测序数据。

亚微升级液体中的细胞裂解

若要进行准确的单细胞分析、制备下一代测序 (NGS) 文库,其前提条件是要从大量样品中有效分离细胞并将其精确沉积到 PCR 板中。我们的单细胞点样机可以配备自动偏移校正 (AOC) 模块,确保将细胞沉积到每个孔的中心,进而实现亚微升液体(例如 350 nL)中的细胞裂解。

检测微型化

利用 I.DOT 非接触式液体处理仪器实现检测微型化并降低成本

自动化液体处理是单细胞文库常规制备过程的关键,因为它有助于缩短手动操作时间、减少操作员偏见。非接触式液体处理仪器能够降低交叉污染风险,而且可节省数千个移液器吸头。由于试剂成本高,而且要分析的单细胞数量不断增加,因此越来越多的实验室已经开始采用亚微升级试剂分液仪器。了解有关如何使用 I.DOT 低容量点样技术,以标准反应体积的 1/10 实现 smart-seq2 和 NGS 文库制备的更多信息。

NGS 文库的定量和标准化

通常,从单细胞中扩增 cDNA 会导致浓度不均,因而需要做标准化处理,以确保所有细胞的读取分布均匀。使用 I.DOT 可在数分钟内对数百个文库进行定量和标准化,最多可实现 96 种试剂的多重反应平行点样。

文库索引和早期条形码

利用独特的 DNA 条形码实现 NGS 文库索引的功能,为高通量单细胞测序的实现奠定了基础。对于单细胞全长转录测序或全外显子组测序,通常在扩增和片段化后对单个文库进行索引。其他 RNA 测序方法(例如:CEL-Seq2)需要早期条形码和单细胞合并,因此需要在逆转录之前添加数百个条形码引物。为免干扰多重反应,必须避免条形码引物之间发生交叉污染。

以超快的速度执行复杂任务

I.DOT 非接触式点样技术的开发目的在于以超快的速度执行最复杂的液体处理任务。单个 I-DOT 源板最多可对 2304 个文库进行唯一条形码编码。96 个唯一条形码的点样不到 60 秒即可完成。

全长转录组测序

到目前为止,smart-seq2 及其变体是在单细胞 RNA 测序方面灵敏度最高、最受欢迎的方法。与其他方法不同,smart-seq2 是一种基于微孔板的检测方法,可实现全长转录覆盖,有助于识别同源异构体、可变剪接事件和突变。

从单细胞 RNA 测序到单细胞蛋白组学和多组学

我们针对基于微孔板的单细胞工作流程推出的平台是一款开放、通用产品,因此适于各种常见的单细胞分析工作流程。我们拥有经验丰富的应用科学家团队,非常乐意为您制定和优化高通量单细胞 RNA 测序方案,也可以在新兴的单细胞蛋白组学和多组学检测方面提供支持。

相关应用记录

全长单细胞 RNA 测序工作流程的微型化和自动化

特色化工作流程

样品制备

单细胞分离

文库制备

测序和分析

提高整个工作流程的效率

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支持细菌、酵母菌及其他微小真菌的高通量单细胞分离,帮助您节省时间和资源。

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在 96 孔板或 384 孔板中分离原核细胞。20 倍放大的亮视野下喷涂成像。分选单细菌,用于培养、基因组学或质谱分析。

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